Bem, na verdade suspeito que só dê para fazer mais ou menos isso que eu disse, por genética apenas.
As populações migram e seus genes vão com elas. Poderia ser que a espécie humana tivesse "surgido", seja lá onde se trace a linha, no oriente médio, mas no decorrer do tempo foi migrando até chegar à África do Sul. Depois, esses que migraram para o sul, voltaram a subir ao norte, mas praticamente sem se misturar com eles, substituindo-os, se ainda estivessem lá. E assim pelo mundo todo.
Se os descendentes vivos hoje traçam na maior parte do tempo sua ancestralidade apenas aos que já haviam chegado no sul, e que posteriormente se expandiram novamente ao redor do mundo, nem todo exame genético do mundo vai dar a localização de que os ancestrais comuns de toda a humanidade viveram no oriente médio. (muito menos de que a espécie surgiu lá, ou em qualquer lugar)
Ao mesmo tempo, não é fácil decartar a possibilidade de ter havido mistura com descendentes da primeira "onda" em direção ao sul da áfrica, e outras populações que eventualmente tivessem saído do oriente médio rumo à Ásia e Europa.
Com variação de genes, DNA mitocondrial e tudo.
Para se ter uma idéia, ainda é há quem defenda variações de evolução multir-regional, com evidência genética. A idéia de que o Homo erectus se espalhou pelo mundo, e através de muita imigração e fluxo genético, o Homo sapiens evoluiu "ao mesmo tempo" e mais gradualmente ao redor do mundo todo. Sugerem ser complicado distinguir populações jovens mas razoavelmente desconexas, de populações mais antigas, mas com considerável fluxo genético, que faz parecer que se separaram a menos tempo.
Ao mesmo tempo, a coisa toda nem resvala na questão da origem da espécie, que é em si um termo bem vago.