Sim, expira.
É que no caso de mamífero, é um tipo de sistema "vai-e-volta": chega ao pulmão, pelos brônquios e volta pelo mesmo lugar.
Nas aves, o ar faz um ciclo, e é necessário 2 movimentos inspiração/expiração para o ar entrar e sair. Porque?
O ar inspirado vai pra um conjunto de sacos aéreos, para depois passar pelos bronquiolos:
Referir-se a unidirecional ou não, é em relação ao movimento ao ar passando pelos bronquíolos.
No desenho:
Redondos: sacos aéreos
Linhas retas entre eles: bronquíolos

No crocodilo, o ar segue passando por diferentes brônquios, como mostrado na figura que o Buck postou.
