De acordo com o Houaiss V.3.0.
herege adj.2g.s.2g. (sXIII) 1 que ou quem professa uma heresia; que ou quem professa doutrina contrária ao que foi estabelecido pela Igreja como dogma 1.1 diz-se de ou cristão católico que, de forma tenaz, nega ou põe em dúvida verdades da fé católica 2 p.ext. que ou quem adota ou sustenta ideias, opiniões, doutrinas etc. contrárias às admitidas (por um grupo) 3 p.ext. que ou aquele que não tem fé religiosa ou não tem respeito ou deferência para com as crenças religiosas alheias; ímpio, ateu, incrédulo ¤ etim provç. ant. heretge < lat. haeretìcus,a,um 'herético, concernente à doutrina herética' < gr. hairetikós,ê,ôn 'que escolhe; sectário, herético' ¤ sin/var ateísta, ateu, céptico, descrente, gentio, heresiarca, herético, heterodoxo, idólatra, ímpio, incrédulo, incréu, infiel, mouro, pagão; como adj.2g.: irreligioso ¤ ant crente, religioso, teísta.
Como se pode notar o significado/uso do termo que impera autalmente é pejorativo e relacionado mais ao significado atribuído pela igreja de acordo com o uso do termo/conceito na história.