Não tem problema algum de incompatibilidade com o popperianismo uma teoria ou ciência não fazer predições, mas retrodições. A questão é lógica:
Se uma teoria
A procede, então um prognóstico
B dedutível de
A também procede. Se as evidências comprovam que
B não procede, conclui-se por
Modus Tollens que a teoria
A também não procede. A saber:

Claro que existem casos mais complexos também, onde são duas teorias juntas que fazem um prognóstico. Neste caso, se os testes negarem o prognóstico, fica em aberto qual das duas (se não forem ambas) são falsas. Como no exemplo:
Se a física newtoniana está correta e o número de planetas no sistema solar é 6, então as órbitas dos planetas estão de acordo com nossos cálculos.
As órbitas dos planetas não estão de acordo com nossos cálculos.
Logo, a física newtoniana está errada ou o número de planetas não é 7.Até já li em algum lugar que Popper falava de uma certa "seleção natural" das teorias. Aquelas que fazem mais predições tem mais chances de prevalecer, como é o caso da física de Newton em relação ao número de planetas.
Mas é isto... é só uma questão de lógica então não importa se o prognóstico seja predição ou retrodição. O darwinismo é científico segundo os critérios popperianos, já que existem falseadores potenciais:
- Fósseis fora do lugar, como cetáceos na Era Mezozóica ou répteis mamaliformes no Pré-Cambriano
- Existência de pseudogenes em desacordo com o esperado pelas filogenias ( i.e. homens compartilhando mais retrovírus endógenos com elefantes do que com sagüis )