Tópico: Novo experimento documenta evolução genômica em tempo quase real

[APODman]

Estamos dando trabalho ao "Designer" fazendo ele atuar em tempo real  para coordenar a criação de mutações não deletérias em laboratório.   

"Vamu trabaia meu Fio !!"    

Novo experimento documenta evolução genômica em tempo quase real

Investigadores identificaram todas as mudanças em um grupo completo de genes de uma bactéria  durante uma experiência de evolução de 44 dias.

Um time liderado por bioengenheiros da UC San Diego apresentaram, na edição de novembro da Nature Genetics, mudanças evolutivas rápidas em um genoma bacteriano, observado quase em tempo real em apenas alguns dias. previamente os cientistas haviam publicado "instantâneos" estáticos das sequências genomicas de mais de 100 espécies de bactérias, das  inofensivas aquelas que causam doenças, mas este novo artigo mostra como estes genomas são "alvos móveis".

"Paleontólogos olham para o registro fóssil para estudar como a evolução de dinossauros e outros animais aconteceu em milhões de anos, mas no caso da bactéria E. coli uma nova tecnologia nos deu a habilidade para observar como a evolução acontece em uma questão de dias", disse Bernhard Ø. Palsson, o autor sênior do estudo e professor de bioengenharia da UCSD. "As sequências genomicas publicadas de bactérias estão como um registro fóssil e nossas experiências confirmam que este genomas podem mudar rapidamente conforme as bactérias se adaptam a novas condições."

Por causa de limitações técnicas passadas, os biólogos historicamente fizeram conclusões sobre a rápida evolução bacteriana  observando cuidadosamente, cada mudança por vez, em um punhado de genes ou monitorando as características visíveis, ou fenótipos, assim que ocorriam adaptações dos organismos. O time de Palsson usou tecnologia de sequenciamento genômico comparativo desenvolvida pela NimbleGen Systems Inc., uma empresa de biotecnologia baseada em Madison, para identificar mudanças que aconteceram durante a experiência no grupo completo de genes da bactéria.

Em um paper programado para ser publicado on-line em 05/11 no site Nature Genetics, os investigadores informam que cultivaram a E. coli em um ambiente que favoreceu o aparecimento de mutantes: os organismos foram alimentados com uma fonte de carbono de difícil metabolismo e baixa energia chamada glicerol. Os investigadores então removeram amostras de celulas da cultura e sequenciaram completamente seus genomas como um modo de achar mutações que habilitaram o rápido crescimento.

Depois de seis dias de crescimento mutações apareceram no gene para uma enzima que inicia o processo, enzimático, de quebra do  glicerol. Células com mutações no gene para glicerol kinase cresceram de 20 a 60 por cento mais rápido do que aqueles sem a mutação.

Mutações também apareceram em um segundo gene, sem conexão com a enzima anterior, para uma enzima chamada RNA polimerase. "Isso foi uma surpresa a quase todos porque a RNA polimerase está envolvida em um dos processos do núcleo de qualquer célula", disse Palsson. "Você não esperaria que aquele gene mudaria porque uma grande variedade de processos celulares seriam afetados; é como substituir o sistema de instalação elétrica de um edifício apenas pq uma lâmpada incandescente queimou. Mas nós repetimos a experiência mais de 50 vezes e as mutações no gene para RNA polimerase mutava novamente e novamente."

Os investigadores informaram que as mutações em ambos os genes apareceram juntas em vários casos entre seis a oito dias nas culturas baseadas em glicerol, e as células de  E. coli que contêm ambos os genes transformados cresceram 150 por cento mais rápido do que a linhagem original de E. coli. Confirmando que os mutantes realmente eram responsáveis pelo crescimento mais rápido, os investigadores substituíram os dois genes dos mutante na linhagem original e duplicaram a taxa de crescimento. "Nós esperávamos achar muitos genes mutados e pensamos que nossos resultados seriam muito difíceis de entender, mas não foi o caso", disse Christopher D. Herring, co-autor do paper e um membro formal do time de Palsson que é agora um cientista pesquisador da Christopher D. Herring em Lebanon, NH.

Todos os mutantes surgiram nas experiências presumivelmente como o resultado de erros naturalmente acontecendo nas cópias de DNA em células-filhas durante a divisão da célula. As mudanças precisas na sequências de subunidades de DNA eram determinadas com tecnologia de sequenciamento genômico comparativo da NimbleGen Systems, e mais adiante analisarados com tecnologia da Sequenom Inc., uma companhia de biotecnologia sediada em San Diego.

"Esta abordagem direta para o estudo de evolução experimental pode ser usada como uma ferramenta para descoberta e análise, e poderia ser usada para descobrir capacidades bacterianas que beneficiariam o ser humano em várias maneiras", disse Herring. "Podem haver várias companhias de biotecnologia que queiram usar esta nova abordagem para projetar bactérias para realização de trabalhos úteis."

O escritório da UCSD de Transferência de Tecnologia e Serviços de Propriedade de Intelectual aceitou a patente para aplicações relacionadas à abordagens de evolução experimental. A abordagem combina técnicas de modelagem computadorizada com processos de design evolutivo para aperfeiçoar bactérias para execução de processos comercialmente importantes. Aparte de seu potencial comercial, a evolução experimental de linhagens bacterianas é também útil para refinar a teoria de evolução e o processo relacionado a seleção natural de indivíduos com características que carregam uma vantagem seletiva de sobrevivência. "Pesquisas de opinião indicam que muitas pessoas não acreditam que a evolução acontece", disse Herring , "mas se os céticos pudessem testemunhar a evolução acontecer de fato, como fizemos nós, eu penso que eles seriam mais propensos a acreditar que não é só uma teoria."

fonte: http://www.eurekalert.org/pub_releases/2006-11/uoc--ned110306.php


nota: observações sobre possíveis correções na tradução são bem vindas


[ ]´s

[Suyndara]

 

Por isso sempre digo que a E. coli é lindaaaaaaaa 

Vamos tentar imaginar como os criancionistas vão se defender dessa   

  pensando bem...nem quero imaginar 

[Pregador]

Muito interessante. Isso também demonstra quanto as bactérias que se ploriferam em uma velocidade alucinante podem ser perigosas se uma mutação nociva a humanos ocorrer, isso em questão de dias, basta um ambiente propício.

[rizk]

"Nós esperávamos achar muitos genes mutados e pensamos que nossos resultados seriam muito difíceis de entender, mas não foi o caso", disse Christopher D. Herring, co-autor do paper

Pelo NÍVEL da discussão, aposto que o trecho acima serviria de evidência para algum bestão falar evolução guiada por um Designer. Até onde lembro, é uma hipótese que vale para AQUELAS PESSOAS.

Amon, você vê os antibióticos pra o stafilococus aureus, se é assim que se escreve. É outra dessas bactérias que muta tão rápido que precisam inventar remédio novo todo ano, assim.
A parte mais legal é que elas estão aqui zanzando sobre nossas peles neste preciso momento. Gaaaah.

[Dr. Manhattan]

Muito interessante! Porém, já imagino o que os IDiotas vão responder: "isso é microevolução, não macroevolução!"

Aliás, esse experimento me lembra aqueles programas de "Vida Artificial" que mostram pseudo-orgranismos
competindo e evoluindo em tempo real... Google google... Achei o link. Vale a pena ver. É um programinha bem
legal chamado Darwin Pond, e é bem útil para demonstrações da evolução:

http://www.ventrella.com/Darwin/darwin.html

[LIAN]

Pensei o mesmo Manhattan. E a ignorância deles não os permite entender que são substituições no DNA que causam mudanças em proteínas. Eles nem devem imaginar que microevolução é responsável por pequenas mudanças morfológicas e funcionais num ser vivo!

[Dr. Manhattan]

Pensei o mesmo Manhattan. E a ignorância deles não os permite entender que são substituições no DNA que causam mudanças em proteínas. Eles nem devem imaginar que microevolução é responsável por pequenas mudanças morfológicas e funcionais num ser vivo!

Pois é, parece um caso clássico de duplipensar: eles até aceitam que pequenas mudanças possam
acontecer rapidamente, mas se recusam a acreditar que muitas mudanças possam se acumular em
um longo intervalo de tempo...

[Atheist]

Por isso sempre digo que a E. coli é lindaaaaaaaa

Vamos tentar imaginar como os criancionistas vão se defender dessa

  pensando bem...nem quero imaginar

[modo criacionista on]Mas você está vendo que tudo foi direcionado com uma mente inteligente! Logo, a vida também precisou de uma mente inteligente por trás da criação (ou evolução, se quiserem chamar assim)[modo criacionista off]

[Atheist]

Pensei o mesmo Manhattan. E a ignorância deles não os permite entender que são substituições no DNA que causam mudanças em proteínas. Eles nem devem imaginar que microevolução é responsável por pequenas mudanças morfológicas e funcionais num ser vivo!

Pois é, parece um caso clássico de duplipensar: eles até aceitam que pequenas mudanças possam
acontecer rapidamente, mas se recusam a acreditar que muitas mudanças possam se acumular em
um longo intervalo de tempo...

Bom, para muitos não existe este longo intervalo de tempo.

[Atheist]

Muito interessante. Isso também demonstra quanto as bactérias que se ploriferam em uma velocidade alucinante podem ser perigosas se uma mutação nociva a humanos ocorrer, isso em questão de dias, basta um ambiente propício.

É o que acontece em relação à resistência a antibióticos. Por isso antibióticos superpotentes não podem ser os primeiros a serem administrados em um paciente.

[LIAN]

Pensei o mesmo Manhattan. E a ignorância deles não os permite entender que são substituições no DNA que causam mudanças em proteínas. Eles nem devem imaginar que microevolução é responsável por pequenas mudanças morfológicas e funcionais num ser vivo!

Pois é, parece um caso clássico de duplipensar: eles até aceitam que pequenas mudanças possam
acontecer rapidamente, mas se recusam a acreditar que muitas mudanças possam se acumular em
um longo intervalo de tempo...

Bom, para muitos não existe este longo intervalo de tempo.

Verdade, Rubens. Seria o sonho de muitos bioinformatas que o relógio molecular de todos os organismos e de todos os genes fosse constante. Bem, com pressões seletivas diferentes, isso seria impossível. Mas pelo menos um gene específico de todos os organismos atuassem como um relógio...1 tic em intervalos constantes. Doce ou melhor amarga ilusão!:D

Será que um dia o Dead vai entender que a DNA polimerase não entende nada de matemática?!:D

[Buckaroo Banzai]

acho que a inconstância de um relógio molecular tem mais a ver com diferentes taxas de mutação / reprodução, mais do que diferentes pressões seletivas.... ainda que as pressões seletivas possam também atrapalhar bastante (mas aparentemente, intuitivamente, menos), seja por efeito de deriva inconstante ou mesmo por seleção direta de algo que não é sempre neutro....

[Suyndara]

[modo criacionista on]Mas você está vendo que tudo foi direcionado com uma mente inteligente! Logo, a vida também precisou de uma mente inteligente por trás da criação (ou evolução, se quiserem chamar assim)[modo criacionista off]

Putz! Me deu até calafrios...hihihihihi

Os crias nunca vão desistir!

[LIAN]

acho que a inconstância de um relógio molecular tem mais a ver com diferentes taxas de mutação / reprodução, mais do que diferentes pressões seletivas.... ainda que as pressões seletivas possam também atrapalhar bastante (mas aparentemente, intuitivamente, menos), seja por efeito de deriva inconstante ou mesmo por seleção direta de algo que não é sempre neutro....

Danniel, a taxa/reprodução seria mais válida para o organismo como um todo, ou pra uma organela, onde a "taxa reprodutiva" é elevada; mas falo das taxas relativas a genes, onde a pressão seletiva positiva ou negativa geralmente atua! Mas como o relógio molecular é feito com base em genes específicos, avaliar essas pressões é essencial. Se quero ver tempo pra divergência dentro de Eukarya posso usar um gene conservado como 28S, se quero ver a população humana, posso usar d-loop (não é gene, e sim região). As pressões nessas diferentes regiões/genes é diferente!

[Buckaroo Banzai]

mas isso que está dizendo....... é encontrar genes essencialmente neutros, em vez de genes sob forte seleção, não? Isso entendo, não dá para querer fazer esse tipo de qualquer coisa com qualquer gene escolhido aleatoriamente...

Mas se fala sobre a pressão seletiva sobre a espécie ou população, aí sim me parece que é mais relevante taxas de reprodução... porque ainda que haja seleção inconstante e imprevisível em um gene ou outro, mas afetando por deriva as seqüências neutras, úteis como relógio... isso não se compara a diferenças drásticas de taxa reprodutiva (e talvez do tamanho total da população?) sobre essas mesmas seqüências, porque simplesmente podem acontecer mais mutações por um dado período de tempo se as taxas reprodutivas são mais elevadas....

mas acho que falei algo até meio óbvio demais, mesmo não sendo isso que pensou que eu quisesse dizer... tem toda aquela coisa de "calibrar" os relógios para cada grupo, e deve ser esse tipo de coisa o que é levado em consideração, em vez de supor que devessem ter as mesmas taxas de mutação/tempo espécies com taxas reprodutivas muito diferentes....

(também não tinha me dado conta disso de estar se referindo a diferença de "velociadade" de genes específicos em vez entre espécies distantes)

[LIAN]

Danniel, essa escolha do gene depende do nível taxonômico que está sendo analisado. Genes neutros podem ser interessantes pra verificar grupos com divergência recente, mas quanto mais distante é a divergência mais mutações são acumuladas num pseudogene, e mais complicado fica verificar a similaridade entre as seqüências analisadas! E quanto as taxas reprodutivas, num trabalho de ecologia é possível fazer, mas quando só fazemos análises em laboratório, não temos como estimar essa taxa!

[Atheist]

Pensei o mesmo Manhattan. E a ignorância deles não os permite entender que são substituições no DNA que causam mudanças em proteínas. Eles nem devem imaginar que microevolução é responsável por pequenas mudanças morfológicas e funcionais num ser vivo!

Pois é, parece um caso clássico de duplipensar: eles até aceitam que pequenas mudanças possam
acontecer rapidamente, mas se recusam a acreditar que muitas mudanças possam se acumular em
um longo intervalo de tempo...

Bom, para muitos não existe este longo intervalo de tempo.

Verdade, Rubens. Seria o sonho de muitos bioinformatas que o relógio molecular de todos os organismos e de todos os genes fosse constante. Bem, com pressões seletivas diferentes, isso seria impossível. Mas pelo menos um gene específico de todos os organismos atuassem como um relógio...1 tic em intervalos constantes. Doce ou melhor amarga ilusão!:D

Será que um dia o Dead vai entender que a DNA polimerase não entende nada de matemática?!:D

Eu estava querendo dizer que para muitos criacionistas não existe esse intervalo de tempo... De qualquer forma tens razão...

[Suyndara]

Quanto tempo eles dizem ter? 6 mil anos?

Desculpe a inocência da pergunta, mas cada criancionista fala de uma data diferente

Mas, mas...e as novas estrelas que estão surgindo?  O grande arquiteto continua criando?

[Dr. Manhattan]

Quanto tempo eles dizem ter? 6 mil anos?

Desculpe a inocência da pergunta, mas cada criancionista fala de uma data diferente

Mas, mas...e as novas estrelas que estão surgindo? O grande arquiteto continua criando?

Pior ainda: os criacionistas até aceitam que existem estrelas a milhões de anos-luz de distância,
cuja luz está chegando apenas agora à Terra.  A resposta deles?
...
...
(sfx: som de tambores)
...
...
Deus criou a luz já a caminho da Terra!

(Tanto trabalho só para fazer com que o universo "pareça" ter bilhões de anos idade...
Esse deus dele tem um senso de humor muito estranho.)

[Dbohr]

Já ouvi que Deus teria criado o mundo com a aparência de ser velho para testar a nossa fé. Mas melhor que essa é quando o crente diz que foi o diabo que criou os fósseis e a taxa de decaimento para enganar a humanidade.

Então tá, né...

[Atheist]

Quanto tempo eles dizem ter? 6 mil anos?

Desculpe a inocência da pergunta, mas cada criancionista fala de uma data diferente

Mas, mas...e as novas estrelas que estão surgindo? O grande arquiteto continua criando?

Mas é a ciência que está dizendo que novas estrelas estão surgindo. Alguém já viu uma estrela nascer, do início ao fim? Não. Apenas deduções. Sistema planetário, então, nem pensar. Logo, tudo não passa de invenção dos cientistas ateus.

[Buckaroo Banzai]

Já ouvi que Deus teria criado o mundo com a aparência de ser velho para testar a nossa fé. Mas melhor que essa é quando o crente diz que foi o diabo que criou os fósseis e a taxa de decaimento para enganar a humanidade.

Então tá, né...

Melhor ainda  é o que uns falam, que não o diabo, mas humanos, forjaram os fósseis... não apenas um ou outro, apontado como intermediário entre formas hoje mais distintas, mas de forma quase generalizada.... ou grandes grupos extintos, mais especificamente talvez... não lembro bem... lembro defenderem que dinossauros seriam quimeras artificiais, misturas de ossos de crocodilos com aves e o que mais fosse necessário.

[Suyndara]

Já ouvi que Deus teria criado o mundo com a aparência de ser velho para testar a nossa fé. Mas melhor que essa é quando o crente diz que foi o diabo que criou os fósseis e a taxa de decaimento para enganar a humanidade.

Então tá, né...

Melhor ainda  é o que uns falam, que não o diabo, mas humanos, forjaram os fósseis... não apenas um ou outro, apontado como intermediário entre formas hoje mais distintas, mas de forma quase generalizada.... ou grandes grupos extintos, mais especificamente talvez... não lembro bem... lembro defenderem que dinossauros seriam quimeras artificiais, misturas de ossos de crocodilos com aves e o que mais fosse necessário.

Putz! Mas que deidade mais temperamental, heim?

Esse lance de farsa me lembrou as estória das estatuetas de acambaro: http://www.imagick.org.br/pagmag/Mystery/imageKBP.JPG

Olha só o que os ufologistas invetaram por conta dessa farsa montada pelos índios mexicanos:

http://www.ufogenesis.com.br/arqueologia/casos/monstros.htm

[Suyndara]

Pior ainda: os criacionistas até aceitam que existem estrelas a milhões de anos-luz de distância,
cuja luz está chegando apenas agora à Terra.  A resposta deles?
...
...
(sfx: som de tambores)
...
...
Deus criou a luz já a caminho da Terra!

(Tanto trabalho só para fazer com que o universo "pareça" ter bilhões de anos idade...
Esse deus dele tem um senso de humor muito estranho.)

Meda, muita meda desses loucos!!!

[Suyndara]

Mas é a ciência que está dizendo que novas estrelas estão surgindo. Alguém já viu uma estrela nascer, do início ao fim? Não. Apenas deduções. Sistema planetário, então, nem pensar. Logo, tudo não passa de invenção dos cientistas ateus.

Ah tá...

Eu havia me esquecido disso, ainda não me familiarizei com a inocência dessas crianças...