Claro que foi montado sob um manto ideológico. Todos os movimentos sociais são (que não significa que serão as mesma ideologias). E, claro, a proposta fim do MST é promover uma revolução socialista no campesinato nos moldes maoístas, imagino. Mas aí dizer que seja um braço montado pelo PT já vai uma diferença enorme. Eles podem ter se aproximado por causa de uma certa afinidade ideológica (principalmente na época do governo FHC) e o PT pode tê-lo usado como massa de manobra em alguns momentos, mas só. De uma maneira geral você vai ver o Pt apoiar todo e qualquer movimento social. Qualquer outra coisa me parece mais teoria da conspiração.
O PT, apesar e por conta do centralismo democrático, é um grande guarda-chuva onde se acomodam város grupos com ideologia e praxis diferentes. Há alguns setores ligados originalmente as Comunidades Eclisiais de Base (CEB) que permanecem vinculados a tese da revolução popular com base no campesinato.
Há uns dois anos um amigo meu que ainda é filiado ao Partido comentou comigo que tem vários outros grupos da "luta campesina" muito mais radicais e incontroláveis que o MST.