Perfeição indica que uma inteligência elaborou algo inteligênte, mesmo que haja deficiências genéticas.
Essa é uma definição bem arbitrária (e anti-intuitiva) de perfeição.
Existe sentido quando perguntamos: Para que serve a consciência, para que serve a pupila dos olhos, para que serve os dentes na boca e por aí vai...
E analisando os fatos, fica evidente que são fruto de seleção natural e não de uma vontade deliberada. Do contrário não haveria tantas imperfeições. Como, por exemplo, a vesícula biliar e o apêndice.
Isto é o que tem sentido de ser perfeito ou então existem regras inteligêntes na natureza em sí???
Essa pergunta é difícil de traduzir. Se você está por acaso perguntando se a natureza é capaz de orientar a formação de órgãos úteis sem uma inteligência verdadeira que a guie, então sim, ela é. Órgãos que tem uma função útil para a sobrevivência e a reprodução são naturalmente encontrados com mais frequência nas gerações seguintes, enquanto que órgãos inúteis ou deficientes simplesmente não são herdados com a mesma frequência porque seus portadores tem menos chance de sobreviver e se reproduzir.
Há uma expressão para essa situação, "pressão seletiva". Pode à primeira vista parecer uma vontade consciente atuando, mas não é esse o caso. É só seleção natural mesmo.