Quando se compreende o que se passa na cabeça das pessoas em geral, se percebe que a crença em Deus é algo natural. Pessoas tem mesmo dificuldade ao lidar com certas coisas da realidade, pois a abstração da realidade das pessoas tem muitos passos onde ela pode se enganar no meio. Tem pessoas que acreditam em Deus e não só acham isso perfeitamente normal como entendem Deus como sendo algo natural.
Conforme a pessoa visa buscar apenas por respostas da realidade, seja por qual motivo for, ela vai buscando métodos para contornar essa abstração da realidade que as pessoas em geral tem para tentar perceber a realidade como ela é de fato. Desses métodos é que surgiu a ciência como é hoje.
Se você considerar que "inteligência" é ter vastos conhecimentos científicos, a chance dessa pessoa ser ateísta é altíssima. Se vê que Deus não faz parte da realidade quando se analisa empiricamente. Se vê que a idéia de Deus não faz muito sentido. Isso não satisfaz pessoas que visam aprender sobre ciência. Mas não faz diferença nenhuma para quem quer aprender sobre outras coisas, como arte, política, etc.
Ateísmo em sí não torna ninguém inteligente. Ele pode até ser o resultado de uma boa pesquisa pessoal por parte de quem quer conhecer melhor a realidade usando a ciência, mas não diz muita coisa por si só quanto á "inteligência" de uma pessoa.
O problema do ateísmo é que, como ele é associado à inteligência dos pesquisadores acadêmicos (por estes serem na maioria ateus), as pessoas acham que ele dá um carimbo de "sou inteligente" para quem é ateu. Quantas vezes já não topei com pessoas que se diziam ateístas mas não eram ateístas de verdade?
Tem pessoas que se dizem ateístas por simplismente não ter religião mas continua acreditando em Deus. Outros se dizem ateus só por serem rebeldes, da mesma maneira como os que geralmente se dizem góticos.
Ateísmo é uma coisa boa, tanto para quem é inteligente ou não. Ele te faz encarar a vida com mais responsabilidade. Mas não deve ser encarado como algo que aumenta a inteligência.
