Um ateu não necessariamente abraça causas como laicismo e ciência.
Quando a ANCOP foi planejada, foi incisiva a sua separação do ateísmo, embora houvesse controvérsias. Era um projeto científico e como tal, naturalmente cético.
Não vejo motivos para uma ONG atéia divulgar a ciência. Teorias cientificas que se propôe explicar as origens o universo e/ou da vida devem ser abordados por ONGs de divulgação científica.
Percebo o óbvio casamento entre o ateísmo e a ciência na maioria dos ateus, mas isso não é regra. Ateu, a grosso modo, é aquele indivíduo que por falta de motivos (leia-se: provas) decidiu não crer na alegação alheia. Um ateu não deixará de ser ateu se ele tiver aversão à ciência.
Por isso acho que uma ONG atéia divulgar a ciência é estranho, pois irá rotular todos os ateus como fanáticos científicos, lembrando que um ateu preferir a ciência como o melhor modo de explicar as coisas é mero detalhe.