Não, não. A ilha realmente existiu.
O purgatório era aquela realidade alterntiva, na cidade, na última temporada. Eles deveriam, nessa realidade, se encontrar para, aparentemente, seguirem em frente (céu). A última temporada foi mostrando, paralelamente, o que aconteceu antes deles morrerem e o purgatório, que é depois que eles morreram.
Se eu não me engano, o Benjamin deixa isso claro, quando diz que alguns deles morreram lá na Ilha (Jack, com a facada do Locke, Sun e Jim, no submarino, etc) e, alguns outros, morreram muitos anos depois, fora da ilha (o Sawyer e a sardenta, por exemplo, que sairam de lá no avião/helicoptero).
E, sim, não foi explicado absolutamente nada.
EDIT: achei um
link que explica direitinho.