Se não fizer, acho que o Avidemux faz. Só não dá para reordenar os trechos de maneira simples, "arrasta e solta" (precisaria fazer as edições/cortes, gravar em arquivos separados, e depois ir acrescentando-os na ordem e então gravar em um novo arquivo), e tem que ter todos a mesma resolução (ou serem convertidos para a mesma resolução previamente, o que pode ser feito num passo anterior).