Quando é que matéria e anti-matéria se aniquilam mutuamente? Quaisquer porções de "anti", ou precisam ser como pares "positivo" e "negativo", "isoméricos" da mesma matéria?
A diferença entre matéria comum e antimatéria é apenas o sinal da carga elétrica e do número leptônico/bariônico (quantidade de leptons/quarks menos quantidade de antileptions/antiquarks).
No caso das partículas elementares, (léptons e quarks), a diferença é essencialmente o sinal da carga. As outras propriedades continuam as mesmas (massa, módulo da carga, etc.)
Luz/fótons têm anti-fótons correspondentes? Ou a anti-luz é escuridão?
Não e não.
Como o fóton é partícula fundamental, não é composto por outras partículas. Também é neutro, portanto não possui carga elétrica (ou seja, o antifoton teria a mesma carga do fóton). Ora, se o antifóton possui a mesma carga, massa, spin e componentes internas (neste caso, nenhuma) do fóton, então ele é indistinguível do fóton. Ou seja se hovuer um antifóton, ele é o próprio fóton, então não existe.
EDIT: No caso do neutron, ele tem carga zero, sim, mas é composto por quarks que possuem carga: um up (carga +2/3) e dois down (carga -1/3). Um antineutron também tem carga elétrica nula, mas é composto por um anti-up (carga -2/3) e dois anti-down (carga +1/3), então é diferente do nêutron. Como o fóton não tem componentes internas, isso não se aplica a ele.
Como é a interação de luz com anti-matéria? Há nisso algo que sugerisse poder ser parte considerável da matéria escura?
Em princípio, a interação é idêntica.