O texto não é contra mutações como parece claro, e sim contra mutações que alguns alegam existir mas jamais foram observadas, mutações de especies
A variação genética entre duas espécies parentes próximas* não é fundamentalmente distinta em sua natureza da variação genética dentro de cada uma dessas espécies, mas da mesma forma, perfeitamente passível de se originar por mutação. Observar a variação entre essas espécies é observar mutações "de espécies".
Mesmo que defenda que os genomas das espécies são altamente específicos, que a imensa maioria das mutações é deletéria, ainda assim as diferenças entre espécies obviamente não são, e ainda são perfeitamente passíveis de se originar por mutações. Não há, de qualquer forma, qualquer argumento sério sobre "vales" de genomas deletérios entre as espécies.
Diga-se de passagem, mesmo a maior parte dos criacionismos hoje em dia aceita a especiação, apesar da contradição a muitas das objeções que eles mesmos levantam, como forma de escapar do ridículo que seriam dezenas de milhões de espécies entrando na arca, muito menor que um zoológico e com muito menos espécies que isso, vivendo lá por cerca de um ano, e etc. Sugerem em vez disso que levaram só umas poucas espécies, que se diversificaram rapidametne após o desembarque.
Não são capazes de delinear limites biológicos para o parentesco biológico "real" no entanto; é arbitrário o que definem como tipos originais de cada grupo, se todos os felídeos descendem só de um casal de gatos, ou se havia um casal Panthera e outro Felis, etc.
* na verdade, entre quaisquer espécies, mesmo distantes, ainda que, obviamente, não se sugira que espécies distantes sejam parentes próximas, por definição.
