Acho pouco provável que o Bolsonaro seja realmente contra o Estado laico. Acredito mais na ignorância dele sobre o significado do termo. Ele deve pensar que Estado laico é um Estado contra a livre manifestação religiosa ou algo assim.
Mas ele deve ter consciência suficiente pra saber que o Brasil não é só cristão, ao dizer que maioria cristã tem mais direitos que as minorias, não tem desculpa.
Ele talvez quis fazer demagogia e populismo com eleitorado de maioria cristã dele, mas acho que ele também tem posicionamento em favor do privilégio cristão (nao sei mais católico, protestantes ou ambos) em detrimento de outras crenças (candomblé, etc) e descrenças.
Só acho curioso ele elogiar Japão, país que maioria não é cristã. No Japão um cara como ele nçao teria vez se fosse apelar pra religião.
O direito de ser ateu não empata o direito de ser cristão. Desde que não tenha esses assuntos pra tratar: casamento gay, legalização do aborto, etc.